1. 课程概述

《生物信息学全攻略：从测序到数据分析实战》是一门系统化、实战导向的高阶课程，专为希望掌握生物信息学核心技能的学员设计。课程覆盖从测序原理到高级数据分析的全流程，结合Linux、R语言等工具，助力学员快速入门并应用于科研或工业场景。

2. 课程亮点

实战驱动：课程包含大量真实案例，如新冠病毒数据分析、基因组拼接和单细胞测序解析，学员可通过动手实践巩固理论。

全技术栈覆盖：从Linux基础到高级Shell编程，从Illumina/PacBio/Nanopore测序技术到宏基因组、RNAseq分析，内容贯穿生物信息学全领域。

前沿技术聚焦：涵盖空间转录组、三代测序变异检测等前沿主题，紧跟学术与产业趋势。

3. 核心模块

Linux与生物软件配置：从目录操作到权限管理，再到生物软件安装（如Bioconda、虚拟环境），夯实分析基础。

多平台测序技术：详解Illumina、PacBio、Nanopore的建库、原理及数据处理，包括FASTQ质控、比对与拼接。

高级分析实战：

- 基因组学：完成图拼接、共线性分析、基因家族研究。

- 转录组学：RNAseq定量、DESeq2/edgeR差异分析、GSEA富集。

- 单细胞与宏基因组：CellRanger流程、Seurat聚类、Metagenome分箱。

4. 学习成果

学员将掌握生物信息学全流程技能，包括：

- 独立处理测序数据（质控、比对、拼接）。

- 利用R语言完成统计建模与可视化（ggplot2、phyloseq）。

- 解决实际科研问题（如病原检测、变异分析）。

5. 适合人群

- 生物/医学背景的研究生、科研人员，希望提升数据分析能力。

- 跨领域学习者，需系统掌握生物信息学工具链。

- 行业从业者，需快速应用新技术（如纳米孔测序、单细胞分析）。

课程以源码课件+操作演示的形式交付，确保学以致用。